Het gemeentebestuur was vanaf 1816 tot 1990 volgens het secretariemodel georganiseerd. De gemeentesecretarie was de centrale organisatie-eenheid binnen de gemeentelijke organisatie. Het diende de gemeenteraad en het college van B&W van advies en ondersteuning en verzorgde de administratie van het bestuur.
De taak van de secretarie was voornamelijk gericht op het maken van beleid. Dit beleid werd na vaststelling door het Gemeentebestuur uitgevoerd door de diensten en bedrijven. Het secretariearchief is daarom het belangrijkste bestuurlijke archief van de gemeente. Het archief over deze tijd is toegankelijk via de volgende inventarissen: Stadsbestuur van 's-Gravenhage, 1816-1851 (BNR 0352), Gemeentebestuur van 's-Gravenhage, 1851-1936 (BNR 0353), Gemeentebestuur van 's-Gravenhage, 1937-1952 (BNR 0610), Gemeentebestuur van 's-Gravenhage, 1953-1990. Vanaf 1991 werd het concern-diensten model ingevoerd.